Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffbO54788 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffbO54788 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffbO54788 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffbO54788 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffbO54788 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffbO54788 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DffbO54788 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DffbO54788 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms