Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DffaO54786 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DffaO54786 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DffaO54786 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DffaO54786 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DffaO54786 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DffaO54786 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms