Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cavin1O54724 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cavin1O54724 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms