Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms