Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sp100O35892 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Sp100O35892 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Sp100O35892 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Sp100O35892 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sp100O35892 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sp100O35892 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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