Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cited2O35740 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cited2O35740 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cited2O35740 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms