Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfibp2O35711 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfibp2O35711 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms