Protein–RNA interactions for Protein: O35681

Syt3, Synaptotagmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt3O35681 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt3O35681 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms