Protein–RNA interactions for Protein: O35657

Neu1, Sialidase-1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu1O35657 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neu1O35657 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neu1O35657 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neu1O35657 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms