Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk2O35491 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clk2O35491 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms