Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1dO35473 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1dO35473 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1dO35473 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1dO35473 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1dO35473 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1dO35473 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1dO35473 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1dO35473 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1dO35473 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1dO35473 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1dO35473 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1dO35473 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1dO35473 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms