Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms