Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccrl2O35457 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms