Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppt2O35448 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms