Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Ptpn9O35239 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Ptpn9O35239 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Ptpn9O35239 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms