Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcns1O35173 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcns1O35173 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcns1O35173 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Kcns1O35173 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Kcns1O35173 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Kcns1O35173 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Kcns1O35173 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Kcns1O35173 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcns1O35173 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Kcns1O35173 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Kcns1O35173 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcns1O35173 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcns1O35173 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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