Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx3O35160 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms