Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra3O35118 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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