Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnih2O35089 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnih2O35089 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms