Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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H2-Q1O19441 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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H2-Q1O19441 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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H2-Q1O19441 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q1O19441 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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H2-Q1O19441 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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H2-Q1O19441 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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H2-Q1O19441 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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H2-Q1O19441 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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H2-Q1O19441 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1O19441 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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