Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha8O09127 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha8O09127 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha8O09127 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms