Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NumblO08919 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NumblO08919 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NumblO08919 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NumblO08919 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NumblO08919 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NumblO08919 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NumblO08919 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NumblO08919 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NumblO08919 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NumblO08919 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NumblO08919 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NumblO08919 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms