Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClockO08785 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClockO08785 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClockO08785 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClockO08785 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClockO08785 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClockO08785 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClockO08785 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClockO08785 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClockO08785 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms