Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp2O08574 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms