Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8050L7N2E3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8050L7N2E3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms