Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3239L7N2D9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms