Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IfnabL7MTU6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
IfnabL7MTU6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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