Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm379J3QQ19 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm379J3QQ19 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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