Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim18J3QNP2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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