Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c2J3QNM1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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