Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm17577J3QNF7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm17577J3QNF7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms