Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20918J3QN17 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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