Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms