Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfip1G5E8V9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms