Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms