Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r58G3X9U3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms