Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms