Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim15G3UY57 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms