Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r39G3UWE6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r39G3UWE6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms