Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r85G3UW56 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r85G3UW56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms