Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34aG3UW52 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms