Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r76F8VQ63 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r76F8VQ63 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms