Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms