Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox13F6YCR7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox13F6YCR7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms