Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8444F6XS56 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms