Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC067074F6RXI4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms