Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms