Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms