Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf165E9QAU8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf165E9QAU8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms