Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms